依据可考察的历史记录，今日迈入百周年、位于市中心的怀仁堂堂址，在一百年前乃是一块荒地。这地是先贤黄天保先生、黄承武先生、江履統先生与黄清波先生等，经富雅各教士同意，并获得众信徒赞助下向粤籍豆腐伯购得。
1920年，黄清波先生等率先筹建木质圣堂。而在1931年，热心的信众再将木质圣堂改建为两层楼的砖质圣堂，楼上作为崇拜用途，而楼下则作为主日学之用。
1954年-1957年间，基于崇拜人数增加，为了教会的永续发展，会友们决定筹资为主建立一座钢骨水泥新圣堂。1957年9月29日，甚富西方传统建筑色彩的红砖圣堂落成并举行了奉献礼。
1965年至1968年间，在牧者与执事会的努力下，主日学与各团契的运作都逐渐上轨道。1969年至1970年，本堂亦相继成立泗里街男女少年军第一分队，透过青少年制服团体活动，积极把福音广传给未信主的青少年。
1975年-1987年间，怀仁堂开始在实拉卓进行福音事工，不仅设立布道处，其后更协助成立卓恩堂。1987 年，本堂在牧区议会上决定在义郎花园一带成立布道中心。三年后（即1990年），义郎花园布道中心升格为另一个堂会，即新怀仁堂。
1999年12月22日，为符合时代脉动的发展需求，怀仁堂开展建筑高四层楼的卫理大厦工程。卫理大厦历时两年竣工，并于 2001年11月2日举行落成奉献礼。2003年2月11日，鉴于看见伊班同胞渴慕福音，本堂乃开始长屋事工，认领 Rumah Balong 和 Rumah Aying，积极带领原住民归主。2007年，怀家再认领Rumah Munang 。2008年8月，按教会发展蓝图，怀家开始兴建全新牧师屋，并于2009年竣工，在2010年6月6日举行奉献礼。2010年与2011年，怀家认领Pakan、Debak、Pusa和Spaoh福音聚点，在积极发展教会硬体设备的同时，也努力广传主耶稣的救恩。

求主继续亲手书写
2016年12月17日，搬迁至旧牧师屋原址的泗华幼儿园举行新校舍奉献礼暨85周年感恩礼拜。同年，在原住民事工上，怀家再认领 Rumah Bajut 。2017年，怀家除了开始在泰南的海外短宣工作，又再认领 Rumah Udin。同年11月4日，新圣堂动土礼隆重登场，邀请砂拉越卫理公会华人年议会会长池金代牧师主持。自此之后，新圣堂的建筑工程便如火如荼地开展。
近年来，怀家除了推动短宣与考察，也开办宣教课程，让会友更清楚主耶稣赋予教会的大使命。怀仁堂百年，不仅栽培出许许多多爱主爱教会的弟兄姐妹，更培育出不少献身者（自1953年开始至2019年，共18位）走往各城各乡，擎举十架、广传福音。怀仁堂，是上帝在泗里街兴起与祝福的教会，是主合用的器皿，是救主福音的出口。2019年11月22日，本堂盛重举行新圣堂落成奉献礼暨百周年庆典。本次庆典，让屹立于泗市中心一百年的怀仁堂正式迈入全新里程碑。拉让江水滔滔，回顾百年历程，感恩天父恩典满满、亲手引领看顾；怀家未来史页，敬虔交托，求主继续亲手书写记载。（王理顺撰稿）